O ensino universitário foi institucionalizado em Angola, no ano de 1962 (decreto-lei 44530, de 21 de Agosto), com a criação dos Estudos Gerais Universitários de Angola, integrados na Universidade Portuguesa.

Em Dezembro de 1968, o decreto-lei 48790 (de 23 de Dezembro) determina a transformação dos Estudos Gerais Universitários de Angola, em Universidade de Luanda, sendo no ano de 1976, após a proclamação da independência de Angola, transformada em Universidade de Angola (portaria 77-A/76, com data de 28 de Setembro).

No dia 24 de janeiro de 1985, por força da resolução 1/85, do CDS (DR 9- 1ª Série, 28/1/1985) a Universidade de Angola passou a chamar-se Universidade Agostinho Neto, em memória do primeiro Presidente de Angola e primeiro Reitor da Universidade de Angola.

O exercício da prática da Democracia na UAN teve início no ano de 1997 com a realização das primeiras eleições para Reitor e Decanos das Unidades Orgânicas. A Reitora eleita na altura foi a Profª Doutora Laurinda Hyoogard.

O actual Reitor da Universidade Agostinho Neto, Prof. Doutor Eng.º João Sebastião Teta, foi eleito, pela primeira vez, em 9 de Janeiro de 2002 (quadriénio 2002-2006) e reeleito em 17 de Novembro de 2005, para o quadriénio 2006-2010.

Actualmente a Universidade Agostinho Neto está implantada em 10 das 18 Províncias do País, contando com: 7 Faculdades, 6 Institutos Superiores de Ciências da Educação, 1 Instituto Superior de Enfermagem e 3 Escolas Superiores, nomeadamente: Faculdade de Ciências (Luanda), Faculdade de Direito (Luanda), Faculdade de Economia (Luanda), Faculdade de Engenharia (Luanda), Faculdade de Medicina (Luanda), Instituto Superior de Enfermagem (Luanda), Instituto Superior de Ciências de Educação (Luanda), Faculdade de Letras e Ciências Sociais (Luanda), Faculdade de Ciências Agrárias (Huambo), Instituto Superior de Ciências de Educação (Lubango), Instituto Superior de Ciências de Educação (Benguela), Instituto Superior de Ciências de Educação (Huambo), Instituto Superior de Ciências de Educação (Cabinda), Instituto Superior de Ciências de Educação (Uíge), Escola Superior Pedagógica (Lunda-Norte), Escola Superior de Ciência e Tecnologia (Lunda-Sul), Escola Superior de Ciência e Tecnologia (Namibe) e Pólo Universitário do Kwanza-Sul (Sumbe).

São ministrados na UAN 68 cursos de Licenciatura 18 de Bacharelato e 15 de Mestrado em diversas áreas do saber científico distribuídos pelas várias faculdades, institutos e escolas superiores. Centros Universitários do País.